A vigilância epidemiológica de Imunização tem por objetivo operacionalizar o processo de vacinação de rotina e campanhas, acompanhar as notificações de eventos adversos pós-vacinação, controle de imunobiológicos especiais, organizar capacitações, monitoramento de coberturas vacinais, distribuição de imunobiológicos e insumos às 28 regionais de saúde do Estado, dentre outras atividades pertinentes a área da imunização. A vacinação também ocorre na Vigilância em Saúde, desde que previamente agendada, no horário de 8h às 13h, de segunda a sexta-feira.